Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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