Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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