Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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BNIP1Q12981 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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BNIP1Q12981 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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BNIP1Q12981 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BNIP1Q12981 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BNIP1Q12981 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BNIP1Q12981 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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BNIP1Q12981 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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