Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTPRJQ12913 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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