Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP6Q0PNE2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms