Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms