Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms