Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA8P48165 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA8P48165 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA8P48165 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms