Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTN2P35609 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms