Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms