Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PLNP26678 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms