Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms