Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms