Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEFHP12036 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms