Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRFP10586 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRFP10586 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms