Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC192P0DO97 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms