Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRTO14522 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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