Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1455.1 ms