Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms