Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCM2LQ9NUG4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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