Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.6 ms