Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms