Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms