Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM208Q9BTX3 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms