Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM175Q9BSA9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms