Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms