Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms