Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms