Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms