Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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PGLYRP3Q96LB9 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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PGLYRP3Q96LB9 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGLYRP3Q96LB9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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