Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA6Q92908 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms