Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms