Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms