Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q71RC1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q71RC1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q71RC1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms