Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms