Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAVIN4Q5BKX8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms