Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms