Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms