Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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