Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SCN9AQ15858 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SCN9AQ15858 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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SCN9AQ15858 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCN9AQ15858 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SCN9AQ15858 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SCN9AQ15858 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN9AQ15858 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN9AQ15858 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SCN9AQ15858 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCN9AQ15858 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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