Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms