Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SIX1Q15475 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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