Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms