Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

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Length 1,273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RASGRF1Q13972 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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