Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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