Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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