Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms