Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCN7AQ01118 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN7AQ01118 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms