Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX1P78337 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX1P78337 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX1P78337 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms