Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms